Alkaloider er fellesnavn på en stor gruppe nitrogenholdige forbindelser som finnes i naturen, de er ofte baser. Over 30 000 alkaloider er beskrevet, de fleste fra planter, men de finnes også i noen sopper, i mikroorganismer og i dyreriket.
Mange av alkaloidene virker på sentralnervesystemet, noen brukes som legemidler, mens andre er modellsubstanser for syntetiske legemidler (se tabellen helt nederst i artikkelen). Eksempler på alkaloider brukt som legemidler er morfin, kinin og atropin. Alkaloider brukes også som rus- og nytelsesmidler. Mange alkaloider er sterke giftstoffer og kan virke beskyttende mot angrep fra andre organismer.
Alkaloider klassifiseres ut ifra hvordan de er bygd opp kjemisk. Alle alkaloider har et nitrogenatom som stammer fra en aminosyre. Ofte er alkaloider bygd opp av en ringstruktur.